Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF17Q9BXT8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF17Q9BXT8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms