Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDRD1Q9BXT4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDRD1Q9BXT4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms