Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms