Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYCP2Q9BX26 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP2Q9BX26 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms