Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFT27Q9BW83 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms