Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUP58Q9BVL2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms