Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms