Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2AQ9BSW2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms