Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TINF2Q9BSI4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms