Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms