Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIOK1Q9BRS2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms