Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF4Q9BRK5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF4Q9BRK5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms