Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GAL3ST1Q99999 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GAL3ST1Q99999 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms