Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CITED2Q99967 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED2Q99967 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms