Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms