Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYD88Q99836 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms