Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP8Q99708 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms