Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms