Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms