Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC9Q96Q05 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms