Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB3A2Q96PL1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms