Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms