Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms