Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNBD2Q96M20 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms