Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC17Q96LX7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC17Q96LX7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms