Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LRIG1Q96JA1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LRIG1Q96JA1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms