Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF496Q96IT1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms