Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MALSU1Q96EH3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282 ms