Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MTERF3Q96E29 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MTERF3Q96E29 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms