Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CMTM5Q96DZ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms