Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM44Q96DX7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM44Q96DX7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms