Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCC1Q96CN9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms