Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMIGD2Q96BF3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms