Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MKL1Q969V6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKL1Q969V6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms