Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA4DQ92854 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms