Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3RF3Q8TEJ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF3Q8TEJ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms