Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FNDC9Q8TBE3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FNDC9Q8TBE3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FNDC9Q8TBE3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNDC9Q8TBE3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNDC9Q8TBE3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNDC9Q8TBE3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNDC9Q8TBE3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FNDC9Q8TBE3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms