Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP32Q8NFA0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP32Q8NFA0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms