Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00116Q8NCU8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00116Q8NCU8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms