Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC191Q8NCU4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC191Q8NCU4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms