Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP38Q8NB14 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms