Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms