Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC71Q8IV32 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC71Q8IV32 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC71Q8IV32 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms