Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MCF2L2Q86YR7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCF2L2Q86YR7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms