Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM25Q86YD3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM25Q86YD3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms