Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC84Q86UT8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC84Q86UT8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms