Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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