Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT27Q7Z3Y8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms