Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT28Q7Z3Y7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms