Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9AQ7Z3C6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms